今天夸克的存在是毋庸置疑的。盖尔曼的许多其他工作仍然是相关的,嵌入到现代粒子物理学的基础上,称为标准模型。但在20世纪80年代,盖尔曼改变了自己的生活,从他在加州理工学院的传统粒子物理学家职位,转向了他共同创办的圣达菲研究所(Santa Fe Institute)在新墨西哥州实践的前卫科学方法。在那里,盖尔曼和其他人开始研究复杂性科学,这是一个新的领域,起初取得了混合的结果,但也取得了一些重大的成功(例如,有助于理解免疫系统的生物学复杂性)。在圣达菲大学,盖尔曼提出了量化复杂性和解释复杂自适应系统的新方法(他称之为IGUSes,用于信息收集和利用系统)。他探索了超越传统语言学的理解语言的新方法,并致力于量子力学的新解释,与他的合作发表了一系列重要论文